調査活動の結果を生かし、地元の住民や、石垣島など八重山諸島の小・中学校の児童・生徒、観光客などを中心に、自然保護・環境保全に関する普及教育活動を実施している。その活動の拠点としてＷＷＦサンゴ礁保護研究センター「しらほサンゴ村」がオープン。サンゴ礁やそれを取り巻く自然と文化についての教材を作成し、パネル展示、ビデオ上映、レクチャーや自然観察会による体験学習など多彩な活動が展開されている。