1993年、「屋久島環境文化村構想」を推進する中心的な組織として鹿児島県と地元の上屋久町、屋久町とで設立された。「屋久島環境文化村構想」とは、世界に誇る島の自然遺産を受け継いでいくとともに、何千年にもわたって積み重ねられてきた自然と人間とのかかわりを手がかりに、自然環境の保護と、そこに住む人々の暮らしを豊かにしていこうとする新たな地域づくりの試みである。